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美國華盛頓大學(xué)團(tuán)隊使用eDNA及PCR技術(shù)尋找保護(hù)動物斑鱉

發(fā)布日期: 2022-02-15
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稀有物種保護(hù)

 

通過水體中的環(huán)境DNA可以有效檢測水生脊椎動物,并且已在濕地和大型河流研究中得到證實[26]。利用環(huán)境DNA檢測河流中的稀有物種和隱秘物種可以增加調(diào)查結(jié)果準(zhǔn)確性,減少調(diào)查成本。Goldberg[8]利用metabarcoding技術(shù),通過收集快速流動的水體環(huán)境DNA樣本,對尾突角蟾(Ascaphus montanus)和愛達(dá)荷陸巨螈(Dicamptodon aterrimus)兩種物種進(jìn)行監(jiān)測。設(shè)計特異性引物尾突角蟾和愛達(dá)荷陸巨螈的線粒體Cyt b區(qū)域的85bp78bp片段,在5個不同物種密度的水樣中均成功進(jìn)行了PCR擴(kuò)增并靈敏地檢測到了目標(biāo)物種的存在。該研究還發(fā)現(xiàn)早春季節(jié)比早秋季節(jié)更難以檢測到兩棲類物種存在,推測可能是由于早春比早秋溫度更低,降低了生物代謝速率而導(dǎo)致。Foote[28]從海水中分離DNA,使用特異性引物擴(kuò)增線粒體DNA區(qū)域60—80bp的片段檢測水體中是否存在港灣鼠海豚(Phocoena phocoena),對控制條件下和自然條件下該物種進(jìn)行遺傳監(jiān)測。在一個樣地中檢測到長肢領(lǐng)航鯨(Globicephala melas),而該物種極少在研究海域被發(fā)現(xiàn),結(jié)果表明環(huán)境DNA的方法可用于檢測稀有物種。Wilcox[27]利用環(huán)境DNA結(jié)合定量PCR檢測了河流中的兩個稀有物種,美洲紅點(diǎn)鮭(Salvelinus fontinalis)和強(qiáng)壯紅點(diǎn)鮭(S.confluentus),同時發(fā)現(xiàn)定量PCR(qPCR)比傳統(tǒng)PCR更加靈敏,檢測概率更高。Rees[25]利用環(huán)境DNA和傳統(tǒng)的實地調(diào)查方法開展對英國保護(hù)物種冠北螈(Triturus cristatus)的監(jiān)測,野外調(diào)查發(fā)現(xiàn)有冠北螈分布的地點(diǎn)中,采集的水樣DNA中成功檢測出冠北螈的概率為84%。使用環(huán)境DNA方法監(jiān)測物種,對物種及其生存環(huán)境不會造成損害。隨著測序成本的下降,環(huán)境DNAmetabarcoding技術(shù)結(jié)合應(yīng)用在許多情況下甚至優(yōu)于一些傳統(tǒng)監(jiān)測方法,成為物種監(jiān)測方法的又一選擇[4]。

 

對視頻中相關(guān)設(shè)備感興趣—eDNA采樣器及現(xiàn)場熒光定量PCR儀 可與我公司聯(lián)系。

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